عند تقييم سلامة الغذاء، يجب أن ينصب التركيز الأساسي على تحديد وفهم المخاطر المحتملة. وقد صنف الباحثون في جميع أنحاء العالم هذه المخاطر إلى ثلاثة أنواع رئيسية: بيولوجية وفيزيائية وكيميائية. ومن بين هذه المخاطر، تعتبر المخاطر البيولوجية الأكثر أهمية، وخاصة في الأغذية المصنعة. ومع ذلك، فإن الجهود المبذولة للقضاء على المخاطر البيولوجية يمكن أن تؤدي في بعض الأحيان إلى زيادة المخاطر الفيزيائية والكيميائية إذا لم يتم التعامل معها بشكل صحيح. على سبيل المثال، غالبًا ما تُضاف المواد الحافظة الكيميائية إلى الأغذية المصنعة لمنع المخاطر الميكروبية، ولكن الإفراط في استخدام هذه المواد الحافظة أو إساءة استخدامها يمكن أن يؤدي إلى مخاطر كيميائية جديدة. لذلك، ترتبط سلامة الأغذية المصنعة ارتباطًا وثيقًا بالطرق المستخدمة في معالجتها، حيث تلعب تقنية المعالجة المختارة دورًا حاسمًا في تحديد السلامة العامة للغذاء.